El Plan Complementario de Biotecnología está gobernado por el Comité de Coordinación Estatal (CCoE) que, a su vez, está formado por el Comité Científico Estatal (CCE), el Comité de Gestión Estatal (CGE) y un representante del Ministerio de Ciencia e Innovación (Dr. Cristóbal Belda).
El CCoE cuenta con el apoyo de la secretaría del Comité Ejecutivo Estatal (CEE).