El CCMIJU es una institución dedicada a la investigación aplicada, la formación y la transferencia de tecnologías en el campo de la cirugía de mínima invasión, y de la sanidad en general. La misión principal del CCMIJU es contribuir al aumento del conocimiento y al uso de las tecnologías relacionadas con la biomedicina y la cirugía mínimamente invasiva, así como otras disciplinas anexas, en el ámbito sociosanitario, mediante la realización de actividades de investigación, diseminación, innovación y transferencia tecnológica en colaboración con otros agentes, a escala internacional.
Las principales áreas estratégicas de investigación que conforman el programa científico del CCMIJU se estructuran en 5 áreas: Cirugía de Mínima Invasión, Terapia celular, Bioingeniería, Reproducción asistida y Cardiovascular.
