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Implementación de tecnologías de transcriptómica espacial de resolución celular con aplicación biosanitaria y desarrollo de métodos coordinados de análisis bioinformáticos estandarizados
LINEA DE ACTUACIÓN 2: IMPLEMENTACIÓN Y ANÁLISIS DE BASES DE DATOS EN MEDICINA DE PRECISIÓN.
Línea de actuación complementaria: LA4. Desarrollo de modelos biológicos para cribado y estudio de la actividad de moléculas terapéuticas.
Palabras clave: medicina de precisión, análisis integrado, algoritmo, bioinformática, secuenciación.
Coordina: Instituto de Parasitología y Biomedicina “López – Neyra”; Consejo Superior de Investigaciones Científicas.
Participa: Instituto de Investigación Biosanitaria; Hospital Universitario Clínico San Cecilio
Persona de contacto: Dr. Javier Martín Ibáñez y Dr. Eduardo Andrés León (javiermartin@ipb.csic.es/
eandres@ipb.csic.es)
En el campo biomédico, la transcriptómica espacial está proporcionando importantes avances dada su capacidad de obtener perfiles transcriptómicos de miles de dianas con una resolución espacial. Esto permite determinar los procesos biológicos que hay detrás de una amplia gama de enfermedades y trastornos, y por ello va a revolucionar la medicina personalizada en los próximos años. En la actualidad, la tecnología más novedosa y con mayor resolución es la secuenciación “ómica” de resolución espacial mejorada, Stereo-seq® de MGI (del inglés: spatial enhanced resolution omics-sequencing). Ésta, no sólo permite una identificación de célula única “sc-omic” más precisa, sino que también facilita la identificación de procesos moleculares alterados en los que interviene un número muy reducido de genes y a menor coste. La aparición de estas tecnologías acompaña el desarrollo de nuevos algoritmos computacionales específicos que son necesarios para el análisis de los datos producidos. La creación, manejo y modificación de estos algoritmos en la investigación biomédica para adecuarla a la naturaleza de los proyectos, requiere de la creación de protocolos de análisis bioinformáticos. Este proyecto aborda un enfoque integral que va desde el procesamiento experimental de muestras, al desarrollo de protocolos de análisis optimizados, posibilitando una rápida interpretación de los resultados obtenidos, tanto en la Comunidad Autónoma de Andalucía, junto con el resto de CCAA, propulsando la medicina personalizada añadiendo una nueva capa de información molecular fundamental en la investigación biomédica y su traslación a la clínica.
COORDINA:
PARTICIPA:
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