{"id":11970,"date":"2024-04-23T10:25:55","date_gmt":"2024-04-23T10:25:55","guid":{"rendered":"https:\/\/planescomplementariossalud.es\/?p=11970"},"modified":"2024-04-23T10:51:30","modified_gmt":"2024-04-23T10:51:30","slug":"transcriptomica-espacial-y-bioinformatica-con-aplicabilidad-biomedica","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/planescomplementariossalud.es\/ca\/transcriptomica-espacial-y-bioinformatica-con-aplicabilidad-biomedica\/","title":{"rendered":"TRANSCRIPT\u00d3MICA ESPACIAL Y BIOINFORM\u00c1TICA CON APLICABILIDAD BIOM\u00c9DICA"},"content":{"rendered":"\n

La plataforma de Andaluc\u00eda-Biotec Salud pone en marcha un proyecto de innovaci\u00f3n para el desarrollo de tecnolog\u00edas de transcript\u00f3mica espacial de resoluci\u00f3n celular y an\u00e1lisis bioinform\u00e1ticos estandarizados con aplicabilidad sanitaria. El proyecto est\u00e1 liderado por el Instituto de Parasitolog\u00eda y Biomedicina L\u00f3pez-Neyra del CSIC-Granada, en colaboraci\u00f3n con otras instituciones andaluzas.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

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La unidad de Bioinform\u00e1tica del Instituto de Parasitolog\u00eda y Biomedicina L\u00f3pez-Neyra – CSIC<\/a>, colabora, dentro del Plan Complementario Andaluc\u00eda-Biotec Salud<\/strong>, en el desarrollo e implementaci\u00f3n de herramientas para el diagn\u00f3stico de enfermedades y terapias avanzadas<\/strong>. Este proyecto liderado por los investigadores Eduardo Andr\u00e9s y Javier Mart\u00edn, est\u00e1 enfocado en la creaci\u00f3n de herramientas bioinform\u00e1ticas con el objetivo de analizar datos de transcript\u00f3mica espacial de c\u00e9lulas individuales.

En la actualidad, las t\u00e9cnicas m\u00e1s novedosas permiten realizar estudios transcript\u00f3micos<\/strong> de cada una de las c\u00e9lulas que forman un tejido u \u00f3rgano de inter\u00e9s, lo que recibe el nombre de secuenciaci\u00f3n ARN de c\u00e9lula \u00fanica<\/strong>, (o en ingl\u00e9s single cell RNA Sequencing o scRNASeq<\/em>). Esta poderosa t\u00e9cnica tiene aplicaciones extensas en diversos campos, como la oncolog\u00eda, la investigaci\u00f3n del desarrollo o la inmunolog\u00eda, entre muchos otros.

El uso de scRNAseq<\/strong> <\/em>no s\u00f3lo permite el estudio y la comprensi\u00f3n de los distintos procesos celulares tales como comunicaci\u00f3n intercelular o respuestas al entorno, sino que, adem\u00e1s, permite identificar la heterogeneidad celular<\/strong> propia de tejidos y \u00f3rganos<\/strong>, y los distintos papeles que ejerce cada c\u00e9lula en situaciones tanto fisiol\u00f3gicas como de enfermedad.<\/p>\n\n\n\n

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Im\u00e1genes de muestras de melanoma humano: las \u00e1reas del tumor aparecen en verde, las c\u00e9lulas inmunitarias en magenta y los n\u00facleos celulares en azul. Fuente: Im\u00e1genes generadas por los investigadores de la Universidad de Granada Natividad Mart\u00edn-Morales, Francisco O\u2019Valle y Pablo Galindo-Moreno.<\/em><\/p>\n\n\n\n

Sin embargo, el estudio de c\u00e9lula \u00fanica no tiene en cuenta el entorno celular, as\u00ed como los diferentes est\u00edmulos que recibe cada c\u00e9lula en funci\u00f3n de la localizaci\u00f3n en la que se encuentra. Este nuevo nivel de informaci\u00f3n representa un punto calve para el diagn\u00f3stico y prognosis de las enfermedades. Por ello, el equipo de investigaci\u00f3n bioinform\u00e1tica del IPBLN, tienen como objetivo el estudio integrado de muestras de transcript\u00f3mica a nivel celular (scRNASeq<\/em>) junto con su localizaci\u00f3n en el tejido<\/strong>. Para ello, los investigadores van a trabajar con el sistema de transcriptomica espacial m\u00e1s potente que existe en la actualidad y denominado Stereo-seq<\/em>: Secuenciaci\u00f3n \u00d3mica de Resoluci\u00f3n Espacial Mejorada<\/strong>, SpaTial Enhanced REsolution Omics-Sequencing (Stereo-seq).<\/em>

Esta nueva estrategia innovadora y puntera en el campo de la transcript\u00f3mica permite a\u00f1adir una nueva capa de informaci\u00f3n que es fundamental en la investigaci\u00f3n biom\u00e9dica y su traslaci\u00f3n a la cl\u00ednica<\/strong>, cumpliendo as\u00ed un objetivo doble. Por una parte, acercar a la pr\u00e1ctica cl\u00ednica tecnolog\u00eda puntera como es la Stereo-seq<\/em>, a la vez que la creaci\u00f3n de una unidad de bioinform\u00e1tica que act\u00fae como punto de referencia gracias al desarrollo de an\u00e1lisis estandarizados que aseguren resultados robustos.<\/p>\n\n\n\n

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Integrantes del departamento de Bioinform\u00e1tica del Instituto de Parasitolog\u00eda y Biomedicina L\u00f3pez-Neyra (IPBLN). De izquierda a derecha: Laura Terr\u00f3n, \u00c1lvaro Mac\u00edas, Jos\u00e9 Luis Ruiz, Eduardo Andr\u00e9s y Daniel Garc\u00eda.<\/em><\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Si quieres tener m\u00e1s informaci\u00f3n acerca del proyecto, no te pierdas esta entrevista con Eduardo Andr\u00e9s, uno de sus investigadores principales. <\/p>\n\n\n\n